Pesawat Japan Airlines diketahui baru saja mendarat dari Bandara Sapporo di Hokkaido, Jepang utara, sebelum mengalami insiden mengerikan ini. Saat ini, penyebab dari kebakaran diduga karna kecelakaan denga pesawat penjaga pantai.
Dalam kecelakaan ini, pesawat penjaga pantai yang bertabrakan dengan pesawat Japan Airlines merupakan jenis Airbus. Lima awak pesawat penjaga pantai tewas dalam insiden tersebut, sedang dalam perjalanan untuk melaksanakan misi pertolongan gempa di Prefektur Ishikawa. Hanya satu orang yang berhasil selamat dalam pesawat jenis Bombardier Dash-8 penjaga pantai yang ditabrak oleh pesawat Japan Airlines.